L’ADN ENVIRONNEMENTAL AU SERVICE DE LA BIODIVERSITE : EVALUATION ET CARACTERISATION

Abstract

L’étude des potentialités agrobiologiques des sols sahariens revêt un intérêt capital pour la mise en valeur. Dans cette optique, la caractérisation de la biodiversité à partir d’ADN issu d’un échantillon de sol est maintenant possible grâce aux nouvelles technologies de séquençage. Elle permet d’effectuer des inventaires, de reconstituer des paléo-environnements et de caractériser des sols. Le recours à cet outil offre de réelles possibilités d’amélioration de connaissances, comme préalable à la caractérisation de la diversité des espèces vivant au sein des écosystèmes pour en comprendre le fonctionnement. Elle devient également un enjeu sociétal puisqu’elle est nécessaire pour mettre en œuvre des programmes de conservation et de restauration des agro-écosystèmes. C’est dans ce contexte qu’une collaboration scientifique a été mise en place en 2013. Le principe de cet outil consiste à extraire l’ADN d’un échantillon environnemental (eau, sol …), puis à amplifier par réaction de polymérisation en chaîne le fragment cible correspondant au code- barres à l’aide d’un couple d’amorces prédéfini. Ces derniers peuvent amplifier un large spectre d’espèces. On parle alors de Metabarcoding. La présente communication a pour objectif de présenter l’outil et sa valeur ajoutée potentielle dans les études agro-écologiques.