ANTIMICROBIAL SCREENING OF Saccharothrix tamanrassetensis DSM 45947 AND EFFECT OF CARBON AND NITROGEN SOURCES ON ANTIBIOTIC PRODUCTION

Abstract

Abstract.- The Algerian Saharan actinobacterium Saccharothrix tamanrassetensis DSM 45947, exhibited an antagonist activity against Gram-positive bacteria, yeasts and filamentous pathogenic, toxigenic and phytopathogenic fungi. The antimicrobial potential of the strain was examined by PCR for the presence of type I and II of polyketide synthase (PKS) and non-ribosomal peptide synthetase (NRPS) gene clusters. The latter gene was detected, but the first two genes were absent. Production of antimicrobial (antifungal and antibacterial) activity was investigated by following kinetics in a semi-synthetic broth supplemented with various carbon and nitrogen sources. The highest activity was obtained with corn steep liquor and sucrose. Antimicrobial compounds were extracted from the culture filtrate. A strong activity was detected in the aqueous phase extract; however the activity in the organic extract was weak. The crude extracts were injected in HPLC for purification. Each fraction was tested for antimicrobial activity. The results revealed 7 active peaks in the aqueous extract, suggesting the presence of novel antibiotics. Résumé.- L’actinobactérie saharienne algérienne Saccharothrix tamanrassetensis DSM 45947 a montré une activité antagoniste contre les bactéries à Gram positif, les levures et les champignons pathogènes, toxinogènes et phytopathogènes. Le potentiel antimicrobien de la souche est examiné par PCR pour la présence des types I et II de polyketide synthase (PKS) et du groupe de gènes non-ribosomal peptide synthetase (NRPS). Ce dernier gène a été détecté, mais les deux premiers gènes étaient absents. La production de l’activité antimicrobienne (antifongique et antibactérienne) a été étudiée en suivant des cinétiques en milieu semi-synthétique additionné de différentes sources de carbone et d’azote. L’activité la plus élevée est obtenue avec le corn steep liquor et le saccharose. Les composés antimicrobiens sont extraits à partir du filtrat de culture. Une forte activité antibiotique est détectée dans l’extrait de la phase aqueuse, en revanche l’activité de la phase organique est faible. Les extraits bruts sont injectés en HPLC pour purification. Chaque fraction a été testée pour l’activité antimicrobienne. Les résultats ont révélé la présence de 7 pics actifs dans l’extrait aqueux, suggérant la présence de nouveaux antibiotiques.